Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCY1

TTBK1, Tau-tubulin kinase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK1Q5TCY1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TTBK1Q5TCY1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TTBK1Q5TCY1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
TTBK1Q5TCY1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TTBK1Q5TCY1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TTBK1Q5TCY1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TTBK1Q5TCY1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms