Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC18Q5T9S5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC18Q5T9S5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CCDC18Q5T9S5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC18Q5T9S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms