Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP58Q5T655 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP58Q5T655 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms