Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2LQ5T4T6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms