Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
FRMPD1Q5SYB0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
FRMPD1Q5SYB0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms