Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VARS2Q5ST30 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VARS2Q5ST30 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VARS2Q5ST30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms