Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHYHD1Q5SRE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHYHD1Q5SRE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms