Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPANXN3Q5MJ09 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPANXN3Q5MJ09 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms