Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COBLL1Q53SF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COBLL1Q53SF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COBLL1Q53SF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms