Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHLDA2Q53GA4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA2Q53GA4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms