Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC23Q53EV4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC23Q53EV4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC23Q53EV4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms