Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SBK1Q52WX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SBK1Q52WX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms