Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C4orf46Q504U0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4orf46Q504U0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms