Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VWA3BQ502W6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3BQ502W6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms