Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GREB1Q4ZG55 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GREB1Q4ZG55 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms