Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTDC1Q4AE62 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTDC1Q4AE62 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms