Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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