Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL40Q2TBA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL40Q2TBA0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL40Q2TBA0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms