Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC96Q2M329 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC96Q2M329 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms