Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFKFB3Q16875 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PFKFB3Q16875 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFKFB3Q16875 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms