Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIST3H3Q16695 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HIST3H3Q16695 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HIST3H3Q16695 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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