Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGISQ16647 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGISQ16647 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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