Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFE2Q16621 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NFE2Q16621 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NFE2Q16621 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms