Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRNP35Q16560 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRNP35Q16560 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRNP35Q16560 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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