Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F4Q16254 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F4Q16254 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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