Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VPS72Q15906 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VPS72Q15906 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
VPS72Q15906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
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