Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP6AP1Q15904 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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