Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEBPEQ15744 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CEBPEQ15744 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEBPEQ15744 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEBPEQ15744 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEBPEQ15744 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEBPEQ15744 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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