Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNHIT3Q15649 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNHIT3Q15649 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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