Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAM1Q15629 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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