Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT31Q15323 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms