Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERPUD1Q15011 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HERPUD1Q15011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERPUD1Q15011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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