Protein–RNA interactions for Protein: Q14679

TTLL4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, humanhuman

Predictions only

Length 1,199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4Q14679 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL4Q14679 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL4Q14679 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL4Q14679 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL4Q14679 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTLL4Q14679 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TTLL4Q14679 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTLL4Q14679 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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