Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEDD9Q14511 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEDD9Q14511 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEDD9Q14511 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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