Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PDE6HQ13956 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PDE6HQ13956 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDE6HQ13956 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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