Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR1Q13613 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR1Q13613 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTMR1Q13613 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTMR1Q13613 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTMR1Q13613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms