Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOP3AQ13472 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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