Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2V1Q13404 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2V1Q13404 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms