Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF1Q13351 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF1Q13351 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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