Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATMQ13315 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATMQ13315 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATMQ13315 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATMQ13315 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATMQ13315 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATMQ13315 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATMQ13315 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATMQ13315 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATMQ13315 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATMQ13315 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATMQ13315 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATMQ13315 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATMQ13315 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATMQ13315 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATMQ13315 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATMQ13315 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATMQ13315 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATMQ13315 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATMQ13315 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATMQ13315 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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