Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGDRQ13258 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGDRQ13258 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGDRQ13258 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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