Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPA4Q13156 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPA4Q13156 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA4Q13156 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms