Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT88Q13099 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFT88Q13099 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT88Q13099 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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