Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK3Q13003 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK3Q13003 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK3Q13003 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
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