Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BNIP1Q12981 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BNIP1Q12981 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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