Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXF2Q12947 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXF2Q12947 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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