Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
COX10Q12887 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COX10Q12887 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COX10Q12887 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX10Q12887 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX10Q12887 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX10Q12887 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COX10Q12887 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COX10Q12887 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COX10Q12887 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COX10Q12887 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COX10Q12887 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COX10Q12887 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COX10Q12887 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms