Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC173Q0VFZ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC173Q0VFZ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms