Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RIPPLY1Q0D2K3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms