Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYP4F3Q08477 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYP4F3Q08477 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms